La anomalía t(9;22)/BCR-ABL1 está asociada a la leucemia mielógena crónica (LMC) y a la leucemia linfoblástica aguda «Filadelfia-positiva» de linaje de células B (LLA Ph+). En muy raras ocasiones, esta anomalía también se ha identificado en casos de leucemia mieloide aguda y leucemia/linfoma linfoblástica T. El gen de fusión en el cromosoma derivado 22q11 produce un transcrito de ARNm BCR-ABL1 quimérico y la correspondiente oncoproteína traducida. A pesar de la considerable heterogeneidad de los puntos de rotura a nivel del ADN, se produce un conjunto consistente de transcritos de ARNm BCR-ABL1 que puede detectarse fácilmente y con sensibilidad mediante la técnica de transcripción inversa-PCR (RT-PCR). En la LMC, los puntos de rotura en BCR dan lugar a los exones 13 o 14 (e13, e14) unidos al exón 2 de ABL1 (a2). Los correspondientes ARNm BCR-ABL1 e13-a2 o e14-a2 producen una proteína de 210 kD (p210). Los casos raros de LMC se caracterizan por un ARNm de tipo e19-a2 con una proteína p230 correspondiente. En la LLA Ph+, la mayoría de los casos albergan un transcrito de ARNm BCR-ABL1 de tipo e1-a2, que produce una proteína p190. Sin embargo, el tipo de ARNm quimérico no se asocia invariablemente con el tipo de enfermedad, como se observa en la presencia de LLA Ph+ p210 y en casos muy raros de LMC p190+. Por lo tanto, los resultados positivos de un ensayo de cribado (diagnóstico) para el ARNm de BCR-ABL1 deben correlacionarse con los hallazgos clínicos y patológicos.

Además de las principales variantes de transcripción descritas anteriormente, los casos raros tanto de LMC como de LLA Ph+ pueden tener eventos alternativos de rotura de fusión que dan lugar a tipos de transcripción de BCR-ABL1 inusuales. Los ejemplos incluyen e6-a2 y fusiones de exón BCR al exón a3 de ABL1 (por ejemplo, e13-a3, e14-a3 o e1-a3). Además de detectar los transcritos comunes de ARNm de BCR-ABL1, este ensayo también puede identificar estas variantes más raras del transcrito de BCR-ABL1 y es, por lo tanto, un cribado exhaustivo de las fusiones genéticas de BCR-ABL1 habituales y no habituales en las neoplasias hematopoyéticas. Sin embargo, dada la naturaleza de los eventos genéticos en los tumores, este ensayo no identificará eventos BCR-ABL1 extremadamente raros e inesperados que involucren otros exones (por ejemplo, el nivel de reporte de casos) y, por lo tanto, no es absolutamente específico, pero se predice que detectará más del 99,5% de los eventos BCR-ABL1. Por lo tanto, se recomienda que para el diagnóstico se utilice la RT-PCR más un segundo método (por ejemplo, BCR-ABL1 FISH o citogenética). Sin embargo, este ensayo de RT-PCR tiene un valor incalculable en el diagnóstico para identificar el tipo preciso de ARNm de BCR-ABL1 (p. ej., para la futura monitorización de la enfermedad mediante un ensayo cuantitativo), lo que no puede hacerse mediante métodos complementarios.

Este ensayo está pensado como un método cualitativo, que proporciona información sobre la presencia (y el tipo específico de ARNm) o la ausencia del ARNm de BCR-ABL1. Los resultados de este ensayo pueden utilizarse para determinar el ensayo subsiguiente correcto para la monitorización de los niveles de transcripción después de la terapia (p. ej., BCRAB / BCR/ABL1, p210, Detección de ARNm, Transcripción-PCR inversa (RT-PCR), Cuantitativa, Monitorización de la Leucemia Mieloide Crónica (LMC), Varía; BA190 / BCR/ABL, p190, Detección de ARNm, Transcripción-PCR inversa (RT-PCR), Cuantitativa, Monitorización del ensayo, Varía). Debido a que el ensayo es analíticamente sensible, compensa situaciones como la calidad del ARN parcialmente degradado, o el bajo número de células, pero no está destinado a fines cuantitativos o de monitorización.

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