Nous examinons le code génétique standard avec trois codons stop. En supposant que la période de synchronisation de longueur 3 dans l’ADN ou l’ARN soit violée pendant les processus de transcription ou de traduction, la probabilité de lire un codon stop décalé est plus élevée que si le code n’avait qu’un seul codon stop. Par conséquent, la synthèse de l’ARN ou des protéines s’arrête rapidement. De cette façon, les cellules ne produisent pas de protéines indésirables et économisent essentiellement de l’énergie. Cette hypothèse est testée sur le génome de la drosophile riche en AT, où la détection des codons stop décalés est encore plus élevée que la valeur théorique. En utilisant le théorème binomial, nous établissons la probabilité de lire un codon stop décalé dans le cadre en n étapes. Comme le code génétique est largement redondant, il reste de la place pour certaines fonctions secondaires cachées de ce code. En particulier, comme les codons stop ne contiennent pas de cytosine, des mutations aléatoires C → U et C → T en troisième position des codons augmentent le nombre d’arrêts décalés dans le cadre et simultanément les mêmes acides aminés sont codés. Cet avantage évolutif est démontré sur les génomes de plusieurs espèces simples, par exemple Escherichia coli.
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