L’anomalia t(9;22)/BCR-ABL1 è associata alla leucemia mieloide cronica (CML) e alla leucemia linfoblastica acuta “Philadelphia-positiva” di linea B (Ph+ ALL). Molto raramente, questa anomalia è stata identificata anche in casi di leucemia mieloide acuta e leucemia/linfoblastica T. Il gene di fusione sul cromosoma derivato 22q11 produce un trascritto chimerico BCR-ABL1 mRNA e la corrispondente oncoproteina tradotta. Nonostante la sostanziale eterogeneità dei breakpoint a livello del DNA, viene prodotto un insieme coerente di trascritti BCR-ABL1 mRNA che possono essere facilmente e sensibilmente rilevati con la tecnica della trascrizione-PCR inversa (RT-PCR). Nella CML, i breakpoints in BCR risultano negli esoni 13 o 14 (e13, e14) uniti all’esone 2 di ABL1 (a2). Gli mRNA BCR-ABL1 corrispondenti e13-a2 o e14-a2 producono una proteina di 210 kD (p210). Rari casi di CML sono caratterizzati da un mRNA di tipo e19-a2 con una corrispondente proteina p230. Nell’ALL+, la maggior parte dei casi ospita una trascrizione di mRNA e1-a2 BCR-ABL1, che produce una proteina p190. Tuttavia, il tipo di mRNA chimerico non è invariabilmente associato al tipo di malattia, come notato dalla presenza di Ph ALL p210-positiva e da casi molto rari di CML p190-positiva. Pertanto, i risultati positivi di un test di screening (diagnostico) per BCR-ABL1 mRNA devono essere correlati con i risultati clinici e patologici.
In aggiunta alle principali varianti di trascrizione descritte sopra, rare occorrenze di CML e Ph+ ALL possono avere eventi di break-fusion alternativi che risultano in tipi di trascrizione BCR-ABL1 insoliti. Gli esempi includono e6-a2 e fusioni esone BCR a esone ABL1 a3 (ad esempio, e13-a3, e14-a3, o e1-a3). Oltre a rilevare comuni trascrizioni BCR-ABL1 mRNA, questo test può anche identificare queste varianti più rare BCR-ABL1 trascrizione ed è, quindi, uno schermo completo per entrambe le fusioni del gene BCR-ABL1 usuali e non comuni in tumori maligni ematopoietici. Data la natura degli eventi genetici nei tumori, tuttavia, questo test non identificherà eventi BCR-ABL1 estremamente rari e inaspettati che coinvolgono altri esoni (ad esempio, il livello di case report) e, pertanto, non è assolutamente specifico, ma è previsto per rilevare più del 99,5% degli eventi BCR-ABL1. Pertanto, si raccomanda che per la diagnosi, RT-PCR più un secondo metodo (ad esempio, BCR-ABL1 FISH o citogenetica) dovrebbe essere utilizzato. Tuttavia, questo test RT-PCR è inestimabile alla diagnosi per identificare il tipo preciso di mRNA BCR-ABL1 (ad esempio, per il futuro monitoraggio quantitativo della malattia), che non può essere fatto con metodi complementari.
Questo test è inteso come un metodo qualitativo, che fornisce informazioni sulla presenza (e il tipo specifico di mRNA) o assenza del mRNA BCR-ABL1. I risultati di questo test possono essere utilizzati per determinare il test successivo corretto per il monitoraggio dei livelli di trascrizione dopo la terapia (ad esempio, BCRAB / BCR/ABL1, p210, rilevamento di mRNA, Trascrizione inversa-PCR (RT-PCR), quantitativo, monitoraggio della leucemia mieloide cronica (CML), variabile; BA190 / BCR/ABL, p190, rilevamento di mRNA, Trascrizione inversa-PCR (RT-PCR), quantitativo, monitoraggio del saggio, variabile). Poiché il test è analiticamente sensibile, compensa situazioni come una qualità dell’RNA parzialmente degradata o un basso numero di cellule, ma non è inteso per scopi quantitativi o di monitoraggio.
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