L’anomalie t(9;22)/BCR-ABL1 est associée à la leucémie myéloïde chronique (LMC) et à la leucémie lymphoblastique aiguë » Philadelphie-positive » de la lignée des cellules B (LAL Ph+). Très rarement, cette anomalie a également été identifiée dans des cas de leucémie myéloïde aiguë et de leucémie/lymphome T-lymphoblastique. Le gène de fusion situé sur le chromosome dérivé 22q11 produit un transcrit ARNm chimérique BCR-ABL1 et une oncoprotéine correspondante traduite. Malgré une hétérogénéité importante des points de cassure au niveau de l’ADN, un ensemble cohérent de transcrits d’ARNm BCR-ABL1 est produit et peut être détecté facilement et de manière sensible par la technique de transcription inverse-PCR (RT-PCR). Dans la LMC, les points de rupture du BCR entraînent la jonction des exons 13 ou 14 (e13, e14) à l’exon 2 de ABL1 (a2). Les ARNm BCR-ABL1 e13-a2 ou e14-a2 correspondants produisent une protéine de 210 kD (p210). De rares cas de LMC sont caractérisés par un ARNm de type e19-a2 avec une protéine p230 correspondante. Dans la LLA Ph+, la majorité des cas héberge un transcrit de l’ARNm BCR-ABL1 de type e1-a2, produisant une protéine p190. Cependant, le type d’ARNm chimérique n’est pas invariablement associé au type de maladie, comme le montre la présence de LAL Ph positive p210 et de très rares cas de LMC positive p190. Par conséquent, les résultats positifs d’un test de dépistage (diagnostic) de l’ARNm BCR-ABL1 doivent être corrélés avec les résultats cliniques et pathologiques.
En plus des principaux variants de transcription décrits ci-dessus, de rares occurrences de LMC et de LAL Ph+ peuvent présenter des événements de rupture-fusion alternatifs résultant en des types de transcription BCR-ABL1 inhabituels. Les exemples incluent e6-a2 et les fusions d’exon BCR à l’exon a3 d’ABL1 (par exemple, e13-a3, e14-a3 ou e1-a3). En plus de détecter les transcrits d’ARNm BCR-ABL1 communs, ce test peut également identifier ces variants de transcrits BCR-ABL1 plus rares et constitue donc un dépistage complet des fusions génétiques BCR-ABL1 habituelles et rares dans les hémopathies malignes. Cependant, étant donné la nature des événements génétiques dans les tumeurs, ce test n’identifiera pas les événements BCR-ABL1 extrêmement rares et inattendus impliquant d’autres exons (par exemple, au niveau des rapports de cas) et n’est donc pas absolument spécifique, mais il est prévu de détecter plus de 99,5 % des événements BCR-ABL1. Par conséquent, il est recommandé d’utiliser la RT-PCR et une deuxième méthode (par exemple, la FISH ou la cytogénétique du BCR-ABL1) pour le diagnostic. Cependant, ce test RT-PCR est précieux au moment du diagnostic pour identifier le type précis d’ARNm BCR-ABL1 (par exemple, pour un futur suivi quantitatif de la maladie), ce qui ne peut être fait par des méthodes complémentaires.
Ce test est conçu comme une méthode qualitative, fournissant des informations sur la présence (et le type d’ARNm spécifique) ou l’absence de l’ARNm BCR-ABL1. Les résultats de ce test peuvent être utilisés pour déterminer le test ultérieur correct pour la surveillance des niveaux de transcription après le traitement (par exemple, BCRAB / BCR/ABL1, p210, détection de l’ARNm, transcription inverse-PCR (RT-PCR), quantitative, surveillance de la leucémie myéloïde chronique (LMC), variable ; BA190 / BCR/ABL, p190, détection de l’ARNm, transcription inverse-PCR (RT-PCR), quantitative, test de surveillance, variable). Comme le test est sensible sur le plan analytique, il compense des situations telles qu’une qualité d’ARN partiellement dégradée ou un faible nombre de cellules, mais il n’est pas destiné à des fins quantitatives ou de surveillance.
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