L’étude
Nous avons identifié les cas à l’origine des épidémies en examinant les rapports d’enquête sur les épidémies de tuberculose rédigés par le personnel des Centers for Disease Control and Prevention (CDC) entre 2002 et 2011. Dans une publication précédente, nous avons décrit comment les équipes des CDC qui aident les partenaires de la santé publique à lutter contre les épidémies de tuberculose rédigent des rapports standardisés sur les enquêtes de terrain, qui comprennent la collecte de données primaires et les réinterrogatoires de patients (3). Pour cette revue, nous avons inclus les épidémies basées aux États-Unis qui 1) avaient >3 cas confirmés par culture qui avaient des liens épidémiologiques et des souches de TB avec des génotypes correspondants et 2) avaient le cas source initial dans la chaîne de transmission, tel que déterminé par cette enquête, identifié dans le rapport écrit. Au moins deux co-auteurs ont examiné indépendamment chaque rapport d’épidémie pour en extraire les caractéristiques démographiques, cliniques et sociales des patients. Lorsque ce double processus de saisie des données a révélé des divergences, les auteurs se sont réunis pour examiner le rapport et parvenir à un consensus.
Notre principal intérêt était le cas source initial, c’est-à-dire le cas de tuberculose qui a commencé une chaîne de transmission de M. tuberculosis qui deviendrait localement reconnue comme une épidémie. La durée de l’éclosion a été calculée à partir de la date de début du traitement du premier cas déclaré et jusqu’à la date de début du traitement du dernier cas, tel que noté au moment de l’enquête. La période infectieuse des cas de tuberculose pulmonaire a été supposée commencer 3 mois avant l’apparition des symptômes de la tuberculose et se terminer avec le début du traitement antituberculeux (1).
Sur les 65 épidémies de tuberculose que le CDC a aidé à enquêter au cours de la période 2002-2011, 26 au total répondaient aux critères d’inclusion. La raison la plus fréquente d’exclusion était de ne pas atteindre le seuil de >3 cas confirmés par culture ayant des liens épidémiologiques et des génotypes correspondants (19 épidémies) ; 11 épidémies suffisamment importantes ou des grappes de génotypes de longue date ont été exclues parce qu’un cas source initial n’a pas pu être identifié sans ambiguïté. Les autres raisons d’exclusion comprenaient un contexte international (6 épidémies) ou des données manquantes (3 épidémies).
Dans 20 des 26 épidémies de tuberculose, le patient du cas source était également le premier patient de l’épidémie à être porté à l’attention des autorités de santé publique (c’est-à-dire également le patient du cas index). Dans les 6 autres foyers, un retard dans le diagnostic du cas source signifiait qu’un autre cas du foyer était identifié avant le cas source (délai médian de 2 mois, maximum de 7 mois).
Les caractéristiques des 26 cas sources sont fournies dans le tableau. Les patients-cas étaient âgés de 18 à 62 ans ; la plupart étaient des hommes nés aux États-Unis, et la distribution de la race/ethnie était similaire à celle observée dans la surveillance nationale de la tuberculose (6). Les patients avaient de longues périodes d’infection (médiane 10 mois, intervalle 3-36 mois) ; après avoir consulté un médecin pour des symptômes de tuberculose, ces patients ont souvent connu des retards dans le diagnostic de la tuberculose et donc dans l’instauration du traitement. Tous les patients avaient une tuberculose pulmonaire dont le frottis était positif pour les bacilles acido-alcooliques. La plupart des patients ont signalé une consommation excessive d’alcool ou de drogues illicites ; la moitié d’entre eux avaient été incarcérés à un moment donné dans le passé, et près de la moitié avaient été sans domicile fixe dans l’année précédant le diagnostic. La plupart des cas ont été portés à l’attention de la santé publique parce que le patient a consulté pour des symptômes de tuberculose plutôt que par des enquêtes sur les contacts.
Sur les 26 épidémies, 9 se sont limitées à 1 génération de propagation du patient-casource aux contacts directs de cette personne ; les 17 autres cas ont connu d’autres vagues de transmission au-delà du patient-casource. Au moment des enquêtes, la durée médiane de l’épidémie était de 13 mois (intervalle de 4 à 151 mois), et un total de 242 cas (médiane de 8 par épidémie) ont été diagnostiqués. Les 4 foyers dans lesquels le patient source était incarcéré au moment du diagnostic comptaient de 7 à 9 cas. Pour les 11 épidémies dans lesquelles le patient-source était récemment sans abri, la taille médiane de l’épidémie au moment de l’enquête était de 9 cas, la taille de l’épidémie variant de 3 à 27, cette dernière étant l’épidémie la plus importante de notre examen.
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